آب مورد استفاده در آکواریوم های گیاهی باید حتما فیلتر و تصفیه شوند.در آکواریوم های معمولی نیز استفاده از فیلتر و تصفیه آب توصیه می شود.این کار توسط دستگاههای فیلتر تصفیه آب انجام می شود.دستگاههای فیلتر آب خانگی نیز می تواند در این زمینه مورد استفاده شود.
در صورتی که استفاده از دستگاه فیلتر میسر نباشد و بخواهیم از آب شیر استفاده کنیم باید از تبدیل کننده و مواد آکواسیو استفاده کنیم.این مواد که به صورت شرکتی می باشند آب شیر را به آب مورد نیاز ماهی تبدیل می کند.برای استفاده از این مواد ابتدا این مواد را در آب ریخته و فیلتر را روشن می کنیم.پس از چند ساعت آب شیر به آب مورد نیاز ماهی تبدیل می شود.